डीऑक्सीराइबोन्यूक्लिक अम्ल (DNA) तथा राइबोन्यूक्लिक अम्ल (RNA) न्यूक्लियोटाइड नामक एकलक इकाइयों के रैखिक बहुलक हैं। प्रत्येक न्यूक्लियोटाइड तीन रासायनिक घटकों से मिलकर बना होता है:
- पेंटोज शर्करा (5-कार्बन शर्करा): डीएनए में $\beta$-D-2-डीऑक्सीराइबोज शर्करा होती है जिसके $C2'$ कार्बन पर ऑक्सीजन अनुपस्थित होता है, जिससे डीएनए रासायनिक रूप से अत्यधिक स्थिर होता है। आरएनए में $\beta$-D-राइबोज शर्करा पाई जाती है जिसके $C2'$ स्थिति पर एक मुक्त व अत्यधिक सक्रिय $-OH$ समूह होता है, जो आरएनए को उत्प्रेरकीय एवं क्रियाशील बनाता है।
- नाइट्रोजनी क्षारक (Heterocyclic Bases):
- प्यूरीन (Purines - द्विवलयी): एडेनिन ($A$) एवं ग्वानिन ($G$)। ये शर्करा के $C1'$ कार्बन से $N9-C1'$ $\beta$-N-ग्लाइकोसिडिक बंध द्वारा जुड़े होते हैं।
- पिरिमिडीन (Pyrimidines - एकवलयी): साइटोसिन ($C$), थायमीन ($T$ - केवल डीएनए में), तथा यूरेसिल ($U$ - केवल आरएनए में)। ये शर्करा के $C1'$ कार्बन से $N1-C1'$ $\beta$-N-ग्लाइकोसिडिक बंध द्वारा जुड़े होते हैं। थायमीन का रासायनिक नाम 5-मेथिल यूरेसिल है, जिसका मेथिल समूह डीएनए को प्रकाश-अपघटन से सुरक्षा प्रदान करता है।
- फॉस्फेट समूह: फॉस्फोरिक अम्ल ($H_3PO_4$) न्यूक्लियोसाइड के $5'-OH$ सिरे से फॉस्फोएस्टर बंध द्वारा जुड़ता है। दो न्यूक्लियोटाइड आपस में $3' \to 5'$ फॉस्फोडाइएस्टर बंध द्वारा जुड़कर शर्करा-फॉस्फेट की आधारभूत रीढ़ बनाते हैं।
इरविन चारगाफ ने विभिन्न जीवों के द्विरज्जुक डीएनए (dsDNA) का क्रोमैटोग्राफी विश्लेषण करके चार सार्वभौमिक नियम प्रतिपादित किए (यह नियम एकल-रज्जुक डीएनए या आरएनए पर लागू नहीं होते):
- क्षार समतुल्यता: एडेनिन की मोलर मात्रा थायमीन के बराबर ($[A] = [T]$) तथा ग्वानिन की मात्रा साइटोसिन के बराबर ($[G] = [C]$) होती है।
- प्यूरीन = पिरिमिडीन: कुल प्यूरीन की मात्रा कुल पिरिमिडीन के बराबर होती है: $[A] + [G] = [T] + [C]$, अर्थात् $\frac{[A] + [G]}{[T] + [C]} = 1.0$।
- विशिष्ट क्षार अनुपात (Base Ratio): $\frac{[A] + [T]}{[G] + [C]}$ का मान किसी एक जाति के लिए नियत होता है, किंतु विभिन्न जातियों में भिन्न होता है। यूकेरियोट्स में यह अनुपात सामान्यतः $> 1$ ($AT$-प्रकार) तथा प्रोकैरियोट्स में $< 1$ ($GC$-प्रकार) होता है।
रोज़ालिंड फ्रैंकलिन और मौरिस विल्किंस के एक्स-रे विवर्तन (X-ray diffraction) डेटा के आधार पर जेम्स वाटसन और फ्रांसिस क्रिक ने B-DNA का द्विकुंडलिनी मॉडल प्रस्तुत किया, जिसके मुख्य ज्यामितीय लक्षण निम्नलिखित हैं:
- प्रतिसमांतर रज्जुक (Antiparallel Strands): डीएनए दो पॉलीन्यूक्लियोटाइड श्रृंखलाओं से बना होता है जो विपरीत ध्रुवीयता ($5' \to 3'$ एवं $3' \to 5'$) में स्थित होती हैं।
- पूरक क्षार युग्मन (Complementary Base Pairing): एडेनिन थायमीन के साथ दो हाइड्रोजन बंधों द्वारा ($A = T$) तथा ग्वानिन साइटोसिन के साथ तीन हाइड्रोजन बंधों द्वारा ($G \equiv C$) जुड़ता है।
- कुंडलिनी के आयाम: द्विकुंडलिनी का व्यास $2.0\text{ nm}$ ($20\text{ \AA}$) होता है। यह एक दक्षिणावर्ती (right-handed) कुंडल है जिसकी पिच (एक पूर्ण घुमाव) की लंबाई $3.4\text{ nm}$ ($34\text{ \AA}$) होती है। प्रत्येक घुमाव में 10 क्षार युग्म (base pairs) होते हैं, अतः दो क्रमिक क्षार युग्मों के बीच की दूरी $0.34\text{ nm}$ ($3.4\text{ \AA}$) होती है।
| विशेषता (Feature) | B-DNA (मानक जैविक रूप) | A-DNA (निर्जलीकृत रूप) | Z-DNA (बामावर्ती रूप) |
|---|---|---|---|
| कुंडलन की दिशा (Helix Sense) | दक्षिणावर्ती (Right-handed) | दक्षिणावर्ती (Right-handed) | वामावर्ती (Left-handed) |
| व्यास (Diameter) | $2.0\text{ nm}$ ($20\text{ \AA}$) | $2.6\text{ nm}$ ($26\text{ \AA}$) | $1.8\text{ nm}$ ($18\text{ \AA}$) |
| प्रति घुमाव क्षार युग्म (bp per turn) | 10.0 bp | 11.0 bp | 12.0 bp (6 द्विक) |
| पिच (Helix Pitch) | $3.4\text{ nm}$ ($34\text{ \AA}$) | $2.8\text{ nm}$ ($28\text{ \AA}$) | $4.5\text{ nm}$ ($45\text{ \AA}$) |
| रीढ़ की बनावट (Backbone) | चिकनी नियमित सर्पिलाकार | सघन एवं चौड़ी | जिग-जैग (Zig-zag) विन्यास |